SMP Negeri 1 Dukun mempunyai program unggulan yang meliputi :

1. Kelas Bilingual (Pembelajaran bilingual Matematika & IPA, Conversation, Telling Story) menuju Rintisan Sekolah Berstandar Internasional (RSBI)

2. Kelas Diniyah (Aqidah Akhlaq, Fiqih, Qur’an Hadits, Bahasa Arab)